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雷红星等“阿尔兹海默症染色体区域研究”获进展

近日,中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”研究员雷红星,开展的“阿尔兹海默症染色体区域研究”取得阶段性进展,其研究论文《Chromosome 19p in Alzheimer’s disease: when genome meets transcriptome》于2013年8月在《Journal of Alzheimer's Disease》杂志上发表。该研究证明了在AD的脑部转录组中,染色体区域19p(chromosome 19p, chr19p)是最显著扰动的染色体区域;并提出了基因组和转录组两方面的证据,来表明chr19p在AD致病机理中起到的特殊作用。

阿尔兹海默症(Alzheimer's disease,AD),又称老年痴呆症,是一种进行性发展的致死性神经退行性疾病。目前,在全基因组关联研究(genome-wide association studies, GWAS)的背景下,散发性AD的遗传学机理还不是十分清楚。尽管遗传学研究已经确定了包括chr19p13.2在内的几个与AD显著相关的基因位点,但这些基因位点在AD的致病机理中所起到的功能作用仍有待进一步研究。

为此,雷红星研究员及其研究团队基于AD脑部转录组数据分析,找出了那些在散发性AD中具有较大扰动的基因,这些基因被认为在AD的致病机理中有着重要的调控作用。然后进一步考察了这些基因在不同染色体区域上的分布情况。研究人员发现chr19p是最显著扰动的染色体区域,而且它包含着chr19p13.2条带区。chr19p13.2在之前的遗传学研究中,被认为是迟发型AD(late-onset AD, LOAD)的主要遗传易感区域。与此同时,LOAD最显著的易感基因——APOE相关基因簇,也位于19号染色体的q臂上。基因组和转录组之间这种奇妙的关联,促使研究人员进一步去研究了chr19p 上那些显著扰动基因的功能。最后,研究人员分析了一组到目前为止最大的AD脑部转录组数据集,将其作为文章结论的一个独立验证。

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