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最近,有关DNA双链断裂(DSBs)研究成果相继发表在顶级期刊Nature杂志子刊上。首先科学家提出一种利用全基因组技术进行DNA双链断裂(DSBs)作图新方法,相关研究成果荣登Nature Method杂志。于此同时,Nature杂志另一子刊Nature Neuroscience也刊登了一项成果,讲述了引发DNA双链断裂的因素。
Nature.Med:全基因组DSB作图新方法
近日,科学家提出一种利用全基因组技术进行DNA双链断裂(DSBs)作图新方法,这种作图法以单核苷酸为基本单位,称之为BLESS(direct in situ breaks labeling, enrichment on streptavidin and next-generation sequencing),相关研究论文于2013年3月20日在线发表在Nature Method杂志上。
此项研究由德国法兰克福歌德大学医学院生物化学研究所 II、美国得克萨斯医学科大学转化科学研究院等处研究人员共同完成。
研究人员利用人类和小鼠细胞以及不同的DNA双链断裂(DSBs)诱导因子和测序平台对BLESS法进行验证。BLESS能够识别端粒末端、SCE核酸内切酶诱导的DNA双链断裂以及复杂的DSB全基因组。作为一种原理证明,我们让人类细胞复制压以敏感性基因组为特点,确定了> 2,000非均匀分布的阿非迪霉素敏感区(ASRS),它们中基因过多,富含微卫星重复序列。人类癌症重排区也富含ASRS,许多癌症相关的基因对复制压具有极高的敏感性。